Duới đây là các thông tin và kiến thức về chủ đề dna ligase binds hay nhất khủng long do chính tay đội ngũ chúng tôi biên soạn và tổng hợp:

1. Biology Ch. 12 – DNA Technology and Genomics – Quizlet ( https://quizlet.com › biology-ch-12-dna-technology-an… )

Restriction enzymes & DNA ligase (article) | Khan Academy ( https://www.khanacademy.org › ... › DNA cloning )

2. Restriction enzymes & DNA ligase (article) | Khan Academy ( https://www.khanacademy.org › … › DNA cloning )

  • Tác giả: khủng long www.khanacademy.org

  • Ngày đăng khủng long : 29/6/2021

  • Xếp hạng khủng long : khủng long 1 ⭐ ( 68012 lượt đánh giá khủng long )

  • Xếp hạng khủng long cao nhất: 5 ⭐

  • Xếp hạng khủng long thấp nhất: 2 ⭐

  • Tóm tắt: khủng long Restriction digestion. Sticky ends and blunt ends. Ligation reactions.

  • Khớp với kết quả khủng long tìm kiếm: They recognize and bind to specific sequences of DNA, called restriction sites. Each restriction enzyme recognizes just one or a few restriction sites….

  • Xem Ngay

DNA ligase - Wikipedia ( https://en.wikipedia.org › wiki › DNA_ligase )

3. DNA ligase – Wikipedia ( https://en.wikipedia.org › wiki › DNA_ligase )

  • Tác giả: khủng long en.wikipedia.org

  • Ngày đăng khủng long : 27/5/2021

  • Xếp hạng khủng long : khủng long 2 ⭐ ( 12634 lượt đánh giá khủng long )

  • Xếp hạng khủng long cao nhất: 5 ⭐

  • Xếp hạng khủng long thấp nhất: 4 ⭐

  • Tóm tắt: khủng long Bài viết về DNA ligase – Wikipedia ( https://en.wikipedia.org › wiki › DNA_ligase ) . Đang cập nhật…

  • Khớp với kết quả khủng long tìm kiếm: DNA ligase is a specific type of enzyme, a ligase, (EC 6.5.1.1) that facilitates the joining of DNA strands together by catalyzing the formation of a ……

  • Xem Ngay

DNA ligase I, the replicative DNA ligase - NCBI ( https://www.ncbi.nlm.nih.gov › articles › PMC3881551 )

4. DNA ligase I, the replicative DNA ligase – NCBI ( https://www.ncbi.nlm.nih.gov › articles › PMC3881551 )

  • Tác giả: khủng long www.ncbi.nlm.nih.gov

  • Ngày đăng khủng long : 24/4/2021

  • Xếp hạng khủng long : khủng long 2 ⭐ ( 8864 lượt đánh giá khủng long )

  • Xếp hạng khủng long cao nhất: 5 ⭐

  • Xếp hạng khủng long thấp nhất: 5 ⭐

  • Tóm tắt: khủng long Multiple DNA ligation events are required to join the Okazaki fragments generated during lagging strand DNA synthesis. In eukaryotes, this is primarily carried out by members of the DNA ligase I family. The C-terminal catalytic region of these enzymes …

  • Khớp với kết quả khủng long tìm kiếm: by TRL Howes · 2012 · Cited by 45 (1) DNA ligase I binds and hydrolyses adenosine triphosphate (ATP), releasing pyrophosphate (PPi) and a covalent ligase-adenosine monophosphate (AMP) ……

  • Xem Ngay

Structural and mechanistic conservation in DNA ligases - NCBI ( https://www.ncbi.nlm.nih.gov › articles › PMC113121 )

5. Structural and mechanistic conservation in DNA ligases – NCBI ( https://www.ncbi.nlm.nih.gov › articles › PMC113121 )

  • Tác giả: khủng long www.ncbi.nlm.nih.gov

  • Ngày đăng khủng long : 10/4/2021

  • Xếp hạng khủng long : khủng long 2 ⭐ ( 70485 lượt đánh giá khủng long )

  • Xếp hạng khủng long cao nhất: 5 ⭐

  • Xếp hạng khủng long thấp nhất: 3 ⭐

  • Tóm tắt: khủng long DNA ligases are enzymes required for the repair, replication and recombination of DNA. DNA ligases catalyse the formation of phosphodiester bonds at single-strand breaks in double-stranded DNA. Despite their occurrence in all organisms, DNA ligases show …

  • Khớp với kết quả khủng long tìm kiếm: by AJ Doherty · 2000 · Cited by 189 DNA ligases catalyse the formation of phosphodiester bonds at single-strand breaks between adjacent 3′-hydroxyl and 5′-phosphate termini in double-stranded DNA ……

  • Xem Ngay

From Structure-Function Analyses to Protein Engineering for ... ( https://www.hindawi.com › journals › archaea )

6. From Structure-Function Analyses to Protein Engineering for … ( https://www.hindawi.com › journals › archaea )

  • Tác giả: khủng long www.hindawi.com

  • Ngày đăng khủng long : 16/2/2021

  • Xếp hạng khủng long : khủng long 4 ⭐ ( 57120 lượt đánh giá khủng long )

  • Xếp hạng khủng long cao nhất: 5 ⭐

  • Xếp hạng khủng long thấp nhất: 4 ⭐

  • Tóm tắt: khủng long DNA ligases are indispensable in all living cells and ubiquitous in all organs. DNA ligases are broadly utilized in molecular biology research fields, such as genetic engineering and DNA sequencing technologies. Here we review the utilization of DNA ligases in a variety of in vitro gene manipulations, developed over the past several decades. During this period, fewer protein engineering attempts for DNA ligases have been made, as compared to those for DNA polymerases. We summarize the recent progress in the elucidation of the DNA ligation mechanisms obtained from the tertiary structures solved thus far, in each step of the ligation reaction scheme. We also present some examples of engineered DNA ligases, developed from the viewpoint of their three-dimensional structures.

  • Khớp với kết quả khủng long tìm kiếm: by M Tanabe · Cited by 11 During this period, fewer protein engineering attempts for DNA ligases have been made … the binding of the ligase-adenylylate to the substrate DNA and the ……

  • Xem Ngay

7. structure–function analysis of Lig E DNA ligases ( https://academic.oup.com › nar › article )

  • Tác giả: khủng long academic.oup.com

  • Ngày đăng khủng long : 27/8/2021

  • Xếp hạng khủng long : khủng long 2 ⭐ ( 3314 lượt đánh giá khủng long )

  • Xếp hạng khủng long cao nhất: 5 ⭐

  • Xếp hạng khủng long thấp nhất: 2 ⭐

  • Tóm tắt: khủng long Bài viết về structure–function analysis of Lig E DNA ligases ( https://academic.oup.com › nar › article ) . Đang cập nhật…

  • Khớp với kết quả khủng long tìm kiếm: by A Williamson · 2018 · Cited by 9 DNA ligases catalyze the formation of phosphodiester bonds between adjacent 5′P and 3′OH ends in the backbone of double-stranded DNA and have a ……

  • Xem Ngay

8. Chlorella virus DNA ligase: nick recognition and mutational … ( https://academic.oup.com › nar › article-pdf )

  • Tác giả: khủng long academic.oup.com

  • Ngày đăng khủng long : 7/5/2021

  • Xếp hạng khủng long : khủng long 3 ⭐ ( 25850 lượt đánh giá khủng long )

  • Xếp hạng khủng long cao nhất: 5 ⭐

  • Xếp hạng khủng long thấp nhất: 2 ⭐

  • Tóm tắt: khủng long Bài viết về Chlorella virus DNA ligase: nick recognition and mutational … ( https://academic.oup.com › nar › article-pdf ) . Đang cập nhật…

  • Khớp với kết quả khủng long tìm kiếm: by V Sriskanda · 1998 · Cited by 91 binding pocket of DNA ligase is important for nick recognition. Mutant D29A is active in enzyme– adenylate formation and binds readily to nicked DNA,….

  • Xem Ngay

Structures of DNA-bound human ligase IV catalytic core reveal ... ( https://www.nature.com › nature communications › articles )

9. Structures of DNA-bound human ligase IV catalytic core reveal … ( https://www.nature.com › nature communications › articles )

  • Tác giả: khủng long www.nature.com

  • Ngày đăng khủng long : 30/7/2021

  • Xếp hạng khủng long : khủng long 5 ⭐ ( 34432 lượt đánh giá khủng long )

  • Xếp hạng khủng long cao nhất: 5 ⭐

  • Xếp hạng khủng long thấp nhất: 3 ⭐

  • Tóm tắt: khủng long DNA Ligase IV (LigIV) catalyzes nick sealing of DNA double-strand break substrates during non-homologous end-joining. Here the authors present the crystal structures of two human LigIV DNA-bound catalytic states, which provide insights into its catalytic mechanism and the molecular basis of LIG4 syndrome causing disease mutations.

  • Khớp với kết quả khủng long tìm kiếm: by AM Kaminski · 2018 · Cited by 31 In order to determine the structural mechanisms underlying LigIV DNA substrate binding, we co-crystallized the LigIV catalytic domain LigIV ( ……

  • Xem Ngay

Rapid Time Scale Analysis of T4 DNA Ligase–DNA Binding ( https://pubs.acs.org › doi )

10. Rapid Time Scale Analysis of T4 DNA Ligase–DNA Binding ( https://pubs.acs.org › doi )

  • Tác giả: khủng long pubs.acs.org

  • Ngày đăng khủng long : 12/2/2021

  • Xếp hạng khủng long : khủng long 4 ⭐ ( 62108 lượt đánh giá khủng long )

  • Xếp hạng khủng long cao nhất: 5 ⭐

  • Xếp hạng khủng long thấp nhất: 1 ⭐

  • Tóm tắt: khủng long DNA ligases, essential to both in vivo genome integrity and in vitro molecular biology, catalyze phosphodiester bond formation between adjacent 3′-OH and 5′-phosphorylated termini in dsDNA. This reaction requires enzyme self-adenylylation, using ATP or NAD+ as a cofactor, and AMP release concomitant with phosphodiester bond formation. In this study, we present the first fast time scale binding kinetics of T4 DNA ligase to both nicked substrate DNA (nDNA) and product-equivalent non-nicked dsDNA, as well as binding and release kinetics of AMP. The described assays utilized a fluorescein-dT labeled DNA substrate as a reporter for ligase·DNA interactions via stopped-flow fluorescence spectroscopy. The analysis revealed that binding to nDNA by the active adenylylated ligase occurs in two steps, an initial rapid association equilibrium followed by a transition to a second bound state prior to catalysis. Furthermore, the ligase binds and dissociates from nicked and nonsubstrate dsDNA rapidly with initial association affinities on the order of 100 nM regardless of enzyme adenylylation state. DNA binding occurs through a two-step mechanism in all cases, confirming prior proposals of transient binding followed by a transition to a productive ligase·nDNA (Lig·nDNA) conformation but suggesting that weaker nonproductive “closed” complexes are formed as well. These observations demonstrate the mechanistic underpinnings of competitive inhibition by rapid binding of nonsubstrate DNA, and of substrate inhibition by blocking of the self-adenylylation reaction through nick binding by deadenylylated ligase. Our analysis further reveals that product release is not the rate-determining step in turnover.

  • Khớp với kết quả khủng long tìm kiếm: by RJ Bauer · 2017 · Cited by 14 Through fitting of binding and dissociation experiments by simulation, it is shown that T4 DNA ligase binds both nDNA and non-nicked dsDNA ……

  • Xem Ngay

11. Two DNA-binding and Nick Recognition Modules in Human … ( https://www.jbc.org › article › pdf )

  • Tác giả: khủng long www.jbc.org

  • Ngày đăng khủng long : 7/1/2021

  • Xếp hạng khủng long : khủng long 1 ⭐ ( 60923 lượt đánh giá khủng long )

  • Xếp hạng khủng long cao nhất: 5 ⭐

  • Xếp hạng khủng long thấp nhất: 3 ⭐

  • Tóm tắt: khủng long Bài viết về Two DNA-binding and Nick Recognition Modules in Human … ( https://www.jbc.org › article › pdf ) . Đang cập nhật…

  • Khớp với kết quả khủng long tìm kiếm: by E Cotner-Gohara · 2008 · Cited by 62 Baltimore, Maryland 21201. Human DNA ligase III contains an N-terminal zinc finger domain that binds to nicks and gaps in DNA….

  • Xem Ngay

12. DNA ligase – Escherichia phage T7 – 1.3 gene & protein ( https://www.uniprot.org › uniprot )

  • Tác giả: khủng long www.uniprot.org

  • Ngày đăng khủng long : 12/7/2021

  • Xếp hạng khủng long : khủng long 5 ⭐ ( 31336 lượt đánh giá khủng long )

  • Xếp hạng khủng long cao nhất: 5 ⭐

  • Xếp hạng khủng long thấp nhất: 3 ⭐

  • Tóm tắt: khủng long Bài viết về DNA ligase – Escherichia phage T7 – 1.3 gene & protein ( https://www.uniprot.org › uniprot ) . Đang cập nhật…

  • Khớp với kết quả khủng long tìm kiếm: DNA ligase that seals nicks in double-stranded DNA during DNA replication, DNA recombination and DNA repair in an ATP-dependent reaction. Binds specifically ……

  • Xem Ngay

DNA ligases as therapeutic targets - Translational Cancer ... ( https://tcr.amegroups.com › article › view › html )

13. DNA ligases as therapeutic targets – Translational Cancer … ( https://tcr.amegroups.com › article › view › html )

  • Tác giả: khủng long tcr.amegroups.com

  • Ngày đăng khủng long : 16/4/2021

  • Xếp hạng khủng long : khủng long 1 ⭐ ( 79352 lượt đánh giá khủng long )

  • Xếp hạng khủng long cao nhất: 5 ⭐

  • Xếp hạng khủng long thấp nhất: 3 ⭐

  • Tóm tắt: khủng long DNA ligases as therapeutic targets

  • Khớp với kết quả khủng long tìm kiếm: Human DNA ligases contain a common catalytic core consisting of an oligonucleotide/oligosaccharide binding-fold (OB-fold) domain and an adenylation domain (AdD) ……

  • Xem Ngay

14. Nick sensing by vaccinia virus DNA ligase requires a 5 … ( https://journals.asm.org › … › Vol. 71, No. 12 )

  • Tác giả: khủng long journals.asm.org

  • Ngày đăng khủng long : 24/6/2021

  • Xếp hạng khủng long : khủng long 2 ⭐ ( 70768 lượt đánh giá khủng long )

  • Xếp hạng khủng long cao nhất: 5 ⭐

  • Xếp hạng khủng long thấp nhất: 1 ⭐

  • Tóm tắt: khủng long Bài viết về Nick sensing by vaccinia virus DNA ligase requires a 5 … ( https://journals.asm.org › … › Vol. 71, No. 12 ) . Đang cập nhật…

  • Khớp với kết quả khủng long tìm kiếm: Vaccinia virus DNA ligase has an intrinsic nick-sensing function. The enzyme discriminates at the substrate binding step between a DNA ……

  • Xem Ngay

The Inhibitory Effect of Non-Substrate and Substrate DNA on ... ( https://journals.plos.org › plosone › article › journal.po... )

15. The Inhibitory Effect of Non-Substrate and Substrate DNA on … ( https://journals.plos.org › plosone › article › journal.po… )

  • Tác giả: khủng long journals.plos.org

  • Ngày đăng khủng long : 10/3/2021

  • Xếp hạng khủng long : khủng long 5 ⭐ ( 46410 lượt đánh giá khủng long )

  • Xếp hạng khủng long cao nhất: 5 ⭐

  • Xếp hạng khủng long thấp nhất: 3 ⭐

  • Tóm tắt: khủng long DNA ligases are essential both to in vivo replication, repair and recombination processes, and in vitro molecular biology protocols. Prior characterization of DNA ligases through gel shift assays has shown the presence of a nick site to be essential for tight binding between the enzyme and its dsDNA substrate, with no interaction evident on dsDNA lacking a nick. In the current study, we observed a significant substrate inhibition effect, as well as the inhibition of both the self-adenylylation and nick-sealing steps of T4 DNA ligase by non-nicked, non-substrate dsDNA. Inhibition by non-substrate DNA was dependent only on the total DNA concentration rather than the structure; with 1 μg/mL of 40-mers, 75-mers, or circular plasmid DNA all inhibiting ligation equally. A >15-fold reduction in T4 DNA ligase self-adenylylation rate when in the presence of high non-nicked dsDNA concentrations was observed. Finally, EMSAs were utilized to demonstrate that non-substrate dsDNA can compete with nicked dsDNA substrates for enzyme binding. Based upon these data, we hypothesize the inhibition of T4 DNA ligase by non-nicked dsDNA is direct evidence for a two-step nick-binding mechanism, with an initial, nick-independent, transient dsDNA-binding event preceding a transition to a stable binding complex in the presence of a nick site.

  • Khớp với kết quả khủng long tìm kiếm: by RJ Bauer · 2016 · Cited by 4 Based upon these data, we hypothesize the inhibition of T4 DNA ligase by non-nicked dsDNA is direct evidence for a two-step nick-binding ……

  • Xem Ngay

16. DNA ligase – Proteopedia, life in 3D ( https://proteopedia.org › wiki › index.php › DNA_ligase )

  • Tác giả: khủng long proteopedia.org

  • Ngày đăng khủng long : 10/6/2021

  • Xếp hạng khủng long : khủng long 5 ⭐ ( 5262 lượt đánh giá khủng long )

  • Xếp hạng khủng long cao nhất: 5 ⭐

  • Xếp hạng khủng long thấp nhất: 2 ⭐

  • Tóm tắt: khủng long Bài viết về DNA ligase – Proteopedia, life in 3D ( https://proteopedia.org › wiki › index.php › DNA_ligase ) . Đang cập nhật…

  • Khớp với kết quả khủng long tìm kiếm: In the ATP-dependent LigD the ATP binds between 2 symmetry related LigD molecules. ATP binding site in ATP-dependent DNA ligase from S. solfataricus (2hix)….

  • Xem Ngay

Molecule of the Month: DNA Ligase - PDB-101 ( https://pdb101.rcsb.org › motm )

17. Molecule of the Month: DNA Ligase – PDB-101 ( https://pdb101.rcsb.org › motm )

  • Tác giả: khủng long pdb101.rcsb.org

  • Ngày đăng khủng long : 7/4/2021

  • Xếp hạng khủng long : khủng long 3 ⭐ ( 44259 lượt đánh giá khủng long )

  • Xếp hạng khủng long cao nhất: 5 ⭐

  • Xếp hạng khủng long thấp nhất: 2 ⭐

  • Tóm tắt: khủng long DNA ligase reconnects broken DNA strands, and is used to engineer recombinant DNA

  • Khớp với kết quả khủng long tìm kiếm: DNA ligase reconnects DNA strands when they are broken. It uses a cofactor molecule (shown in red) for power and a special lysine amino acid (shown in magenta) ……

  • Xem Ngay